Eğitim Bilgileri
2019 - 2020
2019 - 2020Post Doktora
Institut Supérieur d''Electronique du Paris, Laboratoire D’Informatique, Signal, Image, Télécommunication Et Électronique, Signal, Image And Telecommunications, Fransa
2006 - 2018
2006 - 2018Doktora
Karadeniz Teknik Üniversitesi, -, Bilgisayar Mühendisliği, Türkiye
2002 - 2006
2002 - 2006Yüksek Lisans
Karadeniz Teknik Üniversitesi, -, Bilgisayar Mühendisliği, Türkiye
1997 - 2001
1997 - 2001Lisans
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, İstatistik Ve Bilgisayar Bilimleri Bölümü, Türkiye
Yaptığı Tezler
2018
2018Doktora
Periapikal Kist ve Keratokistik Odontojenik Tümör Lezyonlarının Yarı Otomatik Bölütlenmesi ve Sınıflandırılması
Karadeniz Teknik Üniversitesi
2006
2006Yüksek Lisans
Karayolu Trafik Simülasyonu
Karadeniz Teknik Üniversitesi
Yabancı Diller
C2 Ustalık
C2 Ustalıkİngilizce
Sertifika, Kurs ve Eğitimler
2019
2019Erasmus Personel Eğitim Alma Hareketliliği
Eğitim Yönetimi ve Planlama
Institut Supérieur d''Electronique du Paris (ISEP)
2015
2015Üniversite Sanayi İşbirliği Uzmanı Rehberlik Eğitimi
Diğer
Gazi Teknoloji Transfer Ofisi
2014
2014Fen Bilimlerinde Araştırma Projesi Hazırlama Eğitimi
Eğitim Yönetimi ve Planlama
TÜBİTAK & Karadeniz Teknik Üniversitesi
Araştırma Alanları
Bilgisayar Bilimleri
Biyoenformatik
Veritabanı ve Veri Yapıları
Veritabanı Sistemleri
Yapay Zeka, Bilgisayarda Öğrenme ve Örüntü Tanıma
Yazılım
Yazılım Mühendisliği
Biyomedikal Mühendisliği
Biyomedikal Görüntü İşleme
Ulaşım Mühendisliği
İstatistik
İstatistik Analiz ve Uygulamaları
Mühendislik ve Teknoloji
Akademik Unvanlar / Görevler
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorDr. Öğr. Üyesi
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Fen Fakültesi, Yazılım Geliştirme
2018 - 2024
2018 - 2024Öğretim Görevlisi Dr.
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Trabzon Meslek Yüksekokulu, Bilgisayar Teknolojileri
2002 - 2018
2002 - 2018Öğretim Görevlisi
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Rektörlük, Enformatik Bölümü
Yönetimsel Görevler
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorBölüm Başkan Yardımcısı
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Fen Fakültesi, Yazılım Geliştirme
2020 - 2024
2020 - 2024MYO Müdür Yardımcısı
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Trabzon Meslek Yüksekokulu
2019 - 2024
2019 - 2024Bölüm Başkan Yardımcısı
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Trabzon Meslek Yüksekokulu, Bilgisayar Teknolojileri Bölümü
2009 - 2012
2009 - 2012Yönetim Kurulu Üyesi
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Sürekli Eğitim Merkezi
2009 - 2012
2009 - 2012Bölüm Başkan Yardımcısı
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Enformatik Bölümü
Akademi Dışı Deneyim
2013 - Devam Ediyor
2013 - Devam EdiyorKurucu / Genel Müdür
Ticari Kuruluş Özel, Yılmaz Bilişim Ar-Ge Danışmanlık Yazılım Mühendislik ve Servis Hizmetleri Ticaret Limited Şirketi
Verdiği Dersler
SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2025
2025Exploring Inhibition Mechanisms in Wildtype and T315I BCR-ABL1: An In Silico Approach Integrating Virtual Screening, MD Simulations, and MM-GBSA Analysis
Balta Ö., Yılmaz E., Tatar Yılmaz G.
JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY , cilt.46, sa.1, ss.1-9, 2025 (SCI-Expanded)
2023
2023A toolbox of machine learning software to support microbiome analysis
Marcos-Zambrano L. J., Lopez-Molina V. M., Bakir-Gungor B., Frohme M., Karaduzovic-Hadziabdic K., Klammsteiner T., et al.
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY , cilt.14, 2023 (SCI-Expanded)
2021
2021Statistical and Machine Learning Techniques in Human Microbiome Studies: Contemporary Challenges and Solutions
Moreno-Indias I., Lahti L., Nedyalkova M., Elbere I., Roshchupkin G., Adilovic M., et al.
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY , cilt.12, 2021 (SCI-Expanded)
2017
2017Computer-aided diagnosis of periapical cyst and keratocystic odontogenic tumor on cone beam computed tomography
Yilmaz E., Kayikcioglu T., Kayipmaz S.
COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE , cilt.146, ss.91-100, 2017 (SCI-Expanded)
Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2021
2021SARS-CoV-2 Ana Proteaz Enzimine Yönelik Antiviral Bileşiklerin Bilgisayar Destekli İlaç Tasarımı Yöntemleri ile Değerlendirilmesi
TATAR YILMAZ G., YILMAZ E.
European Journal of Science and Technology , sa.32, ss.1043-1047, 2021 (Hakemli Dergi)
2021
2021A modified version of GoogLeNet for melanoma diagnosis
YILMAZ E., TROCAN M.
Journal of Information and Telecommunication , cilt.5, ss.1-11, 2021 (ESCI)
Hakemli Kongre / Sempozyum Bildiri Kitaplarında Yer Alan Yayınlar
2023
2023A modified EfficientNet Model for the classification of Toxoplasmosis disease on OCT Images
YILMAZ E.
2023 Innovations in Intelligent Systems and Applications Conference (ASYU), Sivas, Türkiye, 11 - 13 Ekim 2023
2023
2023Klinik İdrar Test Görüntülerinin Sınıflandırılmasında Derin Öğrenme Yöntemlerinin Karşılaştırılması
Yılmaz E.
14. Tıp Bilişimi Kongresi, İzmir, Türkiye, 16 - 18 Mart 2023, ss.76-79
2020
2020Melanoma Detection Using Deep Learning
Favole F., Trocan M., Yılmaz E.
12th International Conference on Computational Collective Intelligence, Dha-Nang, Vietnam, 30 Kasım - 03 Aralık 2020, cilt.12496, ss.816-824
2020
2020Benign and Malignant Skin Lesion Classification Comparison for Three Deep-Learning Architectures
Yılmaz E., Trocan M.
12th Asian Conference on Intelligent Information and Database Systems, ACIIDS 2020, Phuket, Tayland, 23 - 26 Mart 2020, ss.514-524
2017
2017Semi-Automatic Segmentation of Apical Lesions in Cone Beam Computed Tomography Images
YILMAZ E., KAYIKÇIOĞLU T., KAYIPMAZ S.
25th Signal Processing and Communications Applications Conference (SIU), Antalya, Türkiye, 15 - 18 Mayıs 2017
2017
2017Noise Removal of CBCT Images Using an Adaptive Anisotropic Diffusion Filter
YILMAZ E., KAYIKÇIOĞLU T., KAYIPMAZ S.
40th International Conference on Telecommunications and Signal Processing (TSP), Barcelona, İspanya, 5 - 07 Temmuz 2017, ss.650-653
2014
2014Experimental Comparison of Different Noise Reduction Techniques on Cone Beam Computed Tomography Images
YILMAZ E., KAYIKÇIOĞLU T., KAYIPMAZ S.
22nd IEEE Signal Processing and Communications Applications Conference (SIU), Trabzon, Türkiye, 23 - 25 Nisan 2014, ss.2086-2089
2013
2013Konik Işınlı Bilgisayarlı Tomografi Görüntülerindeki Çene Patolojilerinin Rasgele Yürüyüşle Belirlenmesi
YILMAZ E., KAYIKÇIOĞLU T., KAYIPMAZ S., SEZGİN Ö. S.
ULUSLARARASI 8. İSTATİSTİK KONGRESİ, Antalya, Türkiye, 27 - 30 Ekim 2013, ss.272-273
2012
2012Temel Bilişim Eğitiminin Yükseköğretimdeki Yeri: 2005-2012 Analizi
YILMAZ E., DOĞU A. H.
AKADEMİK BİLİŞİM 2012, Uşak, Türkiye, 1 - 03 Şubat 2012, ss.65-70
2011
2011Üniversitelerde Temel Bilişim Eğitimi Nereye Gidiyor?: 2005-2011 Analizi
YILMAZ E., DOĞU A. H.
AKADEMİK BİLİŞİM 2011, Malatya, Türkiye, 2 - 04 Şubat 2011, ss.659-664
2010
2010Orta Öğretimden Üniversiteye Gelen Öğrencilerin Temel Bilgisayar Bilgilerinin il ve Bölge Bazında incelenmesi: Karadeniz Teknik Üniversitesi Uygulaması
DOĞU A. H., YILMAZ E.
AKADEMİK BİLİŞİM 2010, Muğla, Türkiye, 10 - 12 Şubat 2010, cilt.1, ss.91-96
2008
2008Orta Ölçekli Trafik Ağlarının Geliştirilen Bir Yazılım İle Simülasyonu ve Analizi
YILMAZ E., KÖSE C.
Akademik Bilişim 2008, Çanakkale, Türkiye, 30 Ocak - 01 Şubat 2008, ss.411-418
2007
2007Dört Kavşağa Sahip Bir Karayolu Bölümünün Bilgisayar Ortamında Simülasyonu
YILMAZ E., KÖSE C.
12. ELEKTRİK, ELEKTRONİK, BİLGİSAYAR, BİYOMEDİKAL MÜHENDİSLİĞİ ULUSAL KONGRESİ ve FUARI, Eskişehir, Türkiye, 14 - 18 Kasım 2007, ss.299-300
2005
2005Akademisyen Ders Sayfaları Hazırlama Modülü
YILMAZ E.
AKADEMİK BİLİŞİM 2005, Gaziantep, Türkiye, 2 - 04 Şubat 2005, ss.144
2004
2004Kişisel Sayfa ve Ders Sayfası Hazırlama Sistemi
YILMAZ E., Özyurt T., Kuş R.
AKADEMİK BİLİŞİM 2004, Trabzon, Türkiye, 11 - 13 Şubat 2004, ss.22
Kitap & Kitap Bölümleri
2011
2011Microsoft Excel 2010
YILMAZ E., SÖNMEZ A., SÖNMEZ S., KAYA Y., BİNGÖL Ö., GÜNER A., et al.
Temel Bilgi Teknolojileri, BİNGÖL Özkan, Editör, Derya Kitabevi, Trabzon, ss.158-192, 2011
2007
2007Bölüm 3 Word
Yılmaz E., Doğu A. H., Kaya Y., Gürcan F., Sönmez S., Oğuz Y., et al.
Temel Bilgisayar, DOĞU Ali Haydar, Editör, Derya Kitabevi, Trabzon, ss.131-159, 2007
2007
2007Grafikler
Yılmaz E.
Uygulamalı İleri Excel 2003, MISIR Nejat, Editör, Derya Kitabevi, Trabzon, ss.206-251, 2007
2005
2005Microsoft Word
YILMAZ E., DOĞU A. H.
TEMEL BİLGİSAYAR, Doğu A.H., Editör, Şahinkaya Matbaacılık, İstanbul, ss.102-119, 2005
Desteklenen Projeler
2023 - Devam Ediyor
2023 - Devam EdiyorEğitimi ve Araştırmayı Desteklemek için Bilgisayar Teknolojileriyle Entegre Eklemeli İmalat Laboratuvarının Kurulması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
ÖZTEKİN KULOĞLU E. (Yürütücü), AKYAZ ALAÇAM S., AYGÜN Ö., NAS E., YILMAZ E., ÜÇÜNCÜ F., et al.
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam EdiyorBilgisayar Destekli İlaç Tasarımı Yöntemleri ile Yeni BCR-ABL Tirozin Kinaz İnhibitörlerinin Geliştirilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
TATAR YILMAZ G. (Yürütücü), BEKTAŞ Ö., YILMAZ E.
2019 - 2022
2019 - 2022Motorlu Araç Arıza Tespit Sistemi (MATS)
Teknopark
Yılmaz E. (Yürütücü), Aydemir Ö., Akyaz Alaçam S., Köse S.
2019 - 2020
2019 - 2020Dermoskopi Görüntülerinde Gözlemlenen Cilt Lezyonlarının Derin Öğrenme Modelleri Kullanılarak Tespiti ve Sınıflandırılması
TÜBİTAK Projesi
Yılmaz E. (Yürütücü), Trocan M.
2016 - 2020
2016 - 2020Yanık Hastalarının 3-Boyutlu Modellenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
ŞEVİK U. (Yürütücü), BERBER T., TÜRKYILMAZ S., YILMAZ E., KARAKULLUKÇU E., YEGİNOĞLU Y.
2016 - 2017
2016 - 2017Karadeniz Teknik Üniversitesinde Girişimcilik ve Yenilikçilik Potansiyeli ile Üniversite-Sanayi İşbirliği Kapasitesinin Arttırılması İmkanlarının Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
BELDÜZ A. O. (Yürütücü), HACISALİHOĞLU H., SAĞLAM S., YILMAZ E., YILDIZ O.
2014 - 2015
2014 - 2015Şehir İçi ve Şehirlerarası Trafik Şebekelerinin Bilgisayar Ortamında Modellenmesi, Simülasyonu ve Analizini Gerçekleştirecek Yerli Bir Yazılımın Üretilmesi
TÜBİTAK Projesi
BERBER T., ŞEVİK U., KÖSE C., YILMAZ E. (Yürütücü)
2010 - 2011
2010 - 2011AB YOLUNDAKİ TÜRKİYE'YE BİLİŞİM GENÇLİĞİNİN KATKISI
AB Çerçeve Programları Destekli Proje
DOĞU A. H. (Yürütücü), YILMAZ E.
Patent
2017
2017Sentetik Popülasyon Sentezleme Yöntemi
Patent
Tescil Edildi, Buluşun Tescil No: TR 2015 07903 B , Standart Tescil
2017
2017Bir Harita Sağlayıcıdan Yol Tesisleri ve Bağlantılarını Otomatik Olarak Elde Eden Mekanizma
Patent
Tescil Edildi, Buluşun Tescil No: TR 2015 07427 B , Standart Tescil
Bilimsel Hakemlikler
Kasım 2024
Kasım 2024IET IMAGE PROCESSING
SCI Kapsamındaki Dergi
Kasım 2024
Kasım 2024TÜBİTAK Projesi
1501 - Sanayi Ar-Ge Projeleri Destekleme Programı, Karadeniz Teknik Üniversitesi, Türkiye
Ağustos 2024
Ağustos 2024BMC ORAL HEALTH
SCI Kapsamındaki Dergi
Ağustos 2024
Ağustos 2024BMC MEDICAL INFORMATICS AND DECISION MAKING
SCI Kapsamındaki Dergi
Mart 2024
Mart 2024SCIENTIFIC REPORTS
SCI Kapsamındaki Dergi
Ekim 2023
Ekim 2023PATTERN RECOGNITION
SCI Kapsamındaki Dergi
Mayıs 2023
Mayıs 2023EXPERT SYSTEMS WITH APPLICATIONS
SCI Kapsamındaki Dergi
Eylül 2021
Eylül 2021PHYSICS IN MEDICINE AND BIOLOGY
SCI Kapsamındaki Dergi
Haziran 2020
Haziran 2020COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
SCI Kapsamındaki Dergi
Mayıs 2020
Mayıs 2020IEEE ACCESS
SCI Kapsamındaki Dergi
Nisan 2020
Nisan 2020Signal, Image and Video Processing
SCI Kapsamındaki Dergi
Kasım 2019
Kasım 2019Biomedical Physics & Engineering Express
SCI Kapsamındaki Dergi
Ocak 2017
Ocak 2017TURKISH JOURNAL OF ELECTRICAL ENGINEERING AND COMPUTER SCIENCES
SCI Kapsamındaki Dergi
Akademik Dolaşım Faaliyetleri
2019 - 2020
2019 - 2020Doktora Sonrası Araştırma
Doktora Sonrası Araştırma
Institut Supérieur d''Electronique du Paris, Fransa
Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri
01 Eylül 2018 - 01 Eylül 2018
01 Eylül 2018 - 01 Eylül 2018Prof.Dr. Mustafa Karaman Biyomedikal Görüntü İşleme Çalıstayı
Davetli Konuşmacı
İstanbul-Türkiye
01 Aralık 2016 - 01 Aralık 2016
01 Aralık 2016 - 01 Aralık 2016TÜRKİYE İNOVASYON HAFTASI 2016
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
01 Kasım 2016 - 01 Kasım 2016
01 Kasım 2016 - 01 Kasım 20164. TEKNOLOJİ GELİŞTİRME BÖLGELERİ ZİRVESİ
Katılımcı
Ankara-Türkiye
01 Aralık 2015 - 01 Aralık 2015
01 Aralık 2015 - 01 Aralık 2015TÜRKİYE İNOVASYON HAFTASI 2015
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
01 Ekim 2015 - 01 Ekim 2015
01 Ekim 2015 - 01 Ekim 20153. TEKNOLOJİ GELİŞTİRME BÖLGELERİ ZİRVESİ
Katılımcı
ANKARA-Türkiye
01 Nisan 2015 - 01 Nisan 2015
01 Nisan 2015 - 01 Nisan 20154. TET AR-GE PROJE PAZARI
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
01 Aralık 2014 - 01 Aralık 2014
01 Aralık 2014 - 01 Aralık 2014TECHANKARA PROJE PAZARI
Katılımcı
Ankara-Türkiye
01 Kasım 2014 - 01 Kasım 2014
01 Kasım 2014 - 01 Kasım 20142. TEKNOLOJİ GELİŞTİRME BÖLGELERİ ZİRVESİ
Katılımcı
Ankara-Türkiye
01 Nisan 2014 - 01 Nisan 2014
01 Nisan 2014 - 01 Nisan 2014SİGNAL PROCESSİNG AND COMMUNİCATİONS APPLİCATİONS CONFERENCE (SIU), 2014 22ND
Katılımcı
Trabzon-Türkiye
01 Ekim 2013 - 01 Ekim 2013
01 Ekim 2013 - 01 Ekim 2013ULUSLARARASI 8. İSTATİSTİK KONGRESİ
Katılımcı
Antalya-Türkiye
01 Şubat 2012 - 01 Şubat 2012
01 Şubat 2012 - 01 Şubat 2012AKADEMİK BİLİŞİM 2012
Katılımcı
Uşak-Türkiye
01 Ekim 2011 - 01 Ekim 2011
01 Ekim 2011 - 01 Ekim 2011BİLİŞİM KURULTAYI
Katılımcı
Ankara-Türkiye
01 Şubat 2011 - 01 Şubat 2011
01 Şubat 2011 - 01 Şubat 2011AKADEMİK BİLİŞİM 2011
Katılımcı
Malatya-Türkiye
01 Şubat 2010 - 01 Şubat 2010
01 Şubat 2010 - 01 Şubat 2010AKADEMİK BİLİŞİM 2010
Katılımcı
Muğla-Türkiye
01 Şubat 2008 - 01 Şubat 2008
01 Şubat 2008 - 01 Şubat 2008AKADEMİK BİLİŞİM 2008
Katılımcı
Çanakkale-Türkiye
01 Kasım 2007 - 01 Kasım 2007
01 Kasım 2007 - 01 Kasım 200712. ELEKTRİK, ELEKTRONİK, BİLGİSAYAR, BİYOMEDİKAL MÜHENDİSLİĞİ ULUSAL KONGRESİ ve FUARI
Katılımcı
Eskişehir-Türkiye
01 Şubat 2007 - 01 Şubat 2007
01 Şubat 2007 - 01 Şubat 2007AKADEMİK BİLİŞİM 2007
Katılımcı
Kütahya-Türkiye
01 Şubat 2005 - 01 Şubat 2005
01 Şubat 2005 - 01 Şubat 2005AKADEMİK BİLİŞİM 2005
Katılımcı
Gaziantep-Türkiye
01 Şubat 2004 - 01 Şubat 2004
01 Şubat 2004 - 01 Şubat 2004AKADEMİK BİLİŞİM 2004
Katılımcı
Trabzon-Türkiye
01 Şubat 2003 - 01 Şubat 2003
01 Şubat 2003 - 01 Şubat 2003AKADEMİK BİLİŞİM 2003
Katılımcı
Adana-Türkiye
Davetli Konuşmalar
Haziran 2020
Haziran 2020Diş Hekimliğinde Yapay Zeka Uygulamaları
Seminer
Alanya Alaaddin Keykubat Üniversitesi-Türkiye
Eylül 2018
Eylül 2018Semi-automatic Segmentation and Classification of Dental Periapical Lesions
Çalıştay
İstanbul Teknik Üniversitesi-Türkiye
Burslar
2019 - 2020
2019 - 20202219-Yurt Dışı Doktora Sonrası Araştırma Bursu
TÜBİTAK
Yayıncılık Etkinlikleri
Bilimsel Araştırma / Çalışma Grubu Üyelikleri
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorCa22103 - A Comprehensive Network Against Brain Cancer
https://www.cost.eu/actions/CA22103/
The European Cooperation in Science and Technology (COST), Belgium
2023 - Devam Ediyor
2023 - Devam EdiyorCa22125 - Precision Medicine İn Biliary Tract Cancer (Precision-Btc-Network)
https://www.cost.eu/actions/CA22125/
The European Cooperation in Science and Technology (COST), Belgium
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam EdiyorCa21160 - Non-Globular Proteins İn The Era Of Machine Learning (Ml4ngp)
https://www.cost.eu/actions/CA21160/
The European Cooperation in Science and Technology (COST), Belgium
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam EdiyorCa21169 - Information, Coding, And Biological Function: The Dynamics Of Life (Dynalıfe)
https://www.cost.eu/actions/CA21169
The European Cooperation in Science and Technology (COST), Belgium
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam EdiyorCa20124, Maximising Impact Of Multidisciplinary Research In Early Diagnosis Of Neonatal Brain Injury
https://www.cost.eu/actions/CA20124/
The European Cooperation in Science and Technology (COST), Belgium
2020 - 2023
2020 - 2023Ca18131 - Statistical And Machine Learning Techniques In Human Microbiome Studies
https://www.cost.eu/actions/CA18131
The European Cooperation in Science and Technology (COST), Belgium
2020 - 2023
2020 - 2023Ca17137 - A Network For Gravitational Waves, Geophysics And Machine Learning
https://www.cost.eu/actions/CA17137
The European Cooperation in Science and Technology (COST), Belgium
2020 - 2023
2020 - 2023Ca18106 - The Neural Architecture Of Consciousness
https://www.cost.eu/actions/CA18106
The European Cooperation in Science and Technology (COST), Belgium
2008 - 2011
2008 - 2011