Gökkuşağı Alabalığında Laktokokkosise Karşı Genet4ik D4rençlilik: Tam Kardeş Aileler Üzer4nde GWAS ve Gen Anlatımı Analizi


Altinok I., Öztürk R. Ç., Ustaoğlu D., Kayiş Ş., Kurtoğlu I. Z., Arzik Y., ...Daha Fazla

23. Ulusal Su Ürünleri Sempozyumu, Elazığ, Türkiye, 23 - 25 Eylül 2025, ss.14, (Özet Bildiri)

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Elazığ
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.14
  • Karadeniz Teknik Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Amaç: Bu çalışmanın amacı, Türkiye’de yetiştirilen gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss)

populasyonlarında Lactococcus garvieae etkenine karşı genetik dirençliliği belirlemek, bu dirençliliğin kalıtsal

temelini ortaya koymak ve dirençle ilişkili aday gen bölgelerini genom boyu ilişkilendirme (GWAS) ve gen

anlatımı analizleri yoluyla tanımlamaktır. Elde edilecek genetik belirteçlerin, hastalığa dirençli alabalık

hatlarının geliştirilmesine yönelik ıslah programlarında kullanılabilirliği hedeflenmiştir.

Materyal ve Metot: Çalışmada Türkiye’nin farklı bölgelerindeki 13 kuluçkahaneden temin edilen damızlık

gökkuşağı alabalıkları kullanılarak 76 tam kardeş aile oluşturulmuştur. Her bir aile, tek bir dişi ve tek bir

erkekten elde edilen gametlerle yapay döllenme yoluyla üretilmiş, döllenmiş yumurtalar bireysel kuluçka

kaplarında kuluçkalanarak yavrular elde edilmiştir. Yumurtadan çıkan balıklar, ayrı tanklarda büyütülerek 3–

5 gram canlı ağırlığa ulaştırılmıştır. Hastalığa dirençlilik analizleri için her aileden ortalama 40 birey seçilerek

L. garvieae ATCC49156 suşu ile belirlenen LD₅₀ dozunda enfekte edilmiştir. Enfeksiyon sonrası 21 gün

süresince mortalite takibi yapılmış; ölen bireyler “hassas”, sağ kalanlar “dirençli” olarak sınıflandırılmıştır.

Deneme sonunda her bireyden doku örnekleri alınarak %80 etanol içinde -20°C’de DNA izolasyonu yapılana

kadar muhafaza edilmiştir. Fenotipik verilerle birlikte bireylerden elde edilen DNA örnekleri SNP temelli

genotipleme analizlerine tabi tutulmuş, genom boyu ilişkilendirme çalışmaları (GWAS) ile hastalığa dirençle

ilişkili genetik bölgeler tespit edilmiştir.

Bulgular/Sonuç: Yapılan çalışmalar sonucunda, Lactococcus garvieae enfeksiyonuna karşı farklı direnç

seviyeleri gösteren 76 tam kardeş aileden elde edilen bireylerde önemli fenotipik varyasyon gözlenmiştir.

Enfekte edilen balıklar arasında bazı ailelerde yüksek düzeyde dirençlilik, bazılarında ise yüksek hassasiyet

tespit edilmiştir. Bu varyasyon, direnç özelliğinin genetik temelli olduğunu desteklemiştir. GWAS sonucunda,

laktokokkosise karşı dirençle ilişkili anlamlı SNP bölgeleri tanımlanmıştır. Elde edilen sonuçlar, gökkuşağı

alabalığında laktokokkosise karşı dirençlilik özelliğinin genetik olarak seleksiyonla iyileştirilebileceğini ve bu

amaçla kullanılabilecek moleküler belirteçlerin tanımlandığını ortaya koymuştur. Bu çalışma, Türkiye’de yerli

ve dirençli alabalık hatlarının geliştirilmesine yönelik ıslah programları için güçlü bir temel sunmakta; aynı

zamanda sektörde hastalık kaynaklı kayıpların azaltılmasına katkı sağlayacak genetik araçların geliştirilmesini

mümkün kılmaktadır.

Anahtar kelimeler: Gökkuşağı alabalığı, Laktokokkosis, Genom boyu ilişkilendirme analizi (GWAS), Hastalık

dirençliliği, Tam kardeş aileler

Teşekkür: Bu çalışma, TÜBİTAK 1001 programı kapsamında desteklenen 122Y984 numaralı proje çerçevesinde

gerçekleştirilmiş olup, sunulan veriler ilgili proje kapsamında elde edilmiştir.