Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2020
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Fatımatüzehra Şipşak
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Ali İrfan Güzel
Eş Danışman: Tuba Dinçer
Özet:
Dünyada kanser ölümlerinin önde gelen nedenlerinden biri de kolorektal kanser olup
genetik ve epigenetik değişikliklerin birikimi sonucu meydana gelmektedir. Epigenetik
değişikliklerden biri olan DNA metilasyonu, genomik kararlılık ve gen ifadesinin
düzenlenmesinde anahtar bir mekanizma olarak tanımlanmıştır. Genomun çoğunluğunu
oluşturan tekrar dizilerinde meydana gelen DNA metilasyon içeriğindeki bir azalma,
çeşitli malignansilerin oluşumu ile ilişkilendirilmiştir. İnsan genomunun yaklaşık
%17'sini oluşturan LINE-1 tekrar dizileri, DNA metilasyon ölçümü bağlamında en çok
ilgilenilen dizidir. Bu çalışmada kolorektal kanserde, LINE-1 5’ UTR’sinin metilasyon
durumunun incelenmesi amaçlandı. Kolorektal kanser teşhisi konmuş hastalara ait normal
ve tümör arşiv dokusundan DNA izolasyonu yapıldı. LINE-1 5’ UTR’sinin belirlenen altı
farklı bölgesi özel olarak tasarlanmış primer setleri kullanılarak PCR ile çoğaltıldı.
Sonrasında CG dinükleotitlerindeki metilasyon değişimini değerlendirmek amacıyla
HRM analizi yapıldı. 1. bölgenin analizinde normal ve tümörlü dokular arasında anlamlı
bir fark bulundu (p<0.001). Sonuç olarak, bu bölgenin kolorektal kanser olgularında ve
kanserleşme sürecinde metilasyon seviyesindeki azalmanın belirlenmesinde biyobelirteç
olarak kullanılabileceği düşünülmektedir.