Hakkımızda

Bioinformatics & Computational Drug Discovery Group (BioCDD), Karadeniz Teknik Üniversitesi (KTÜ) bünyesinde, biyoinformatik, hesaplamalı biyoloji ve bilgisayar destekli ilaç keşfi alanlarında disiplinler arası araştırmalar yürütmek amacıyla kurulmuş bir araştırma grubudur. Grup, moleküler biyoloji, biyoteknoloji ve yapay zekâ destekli hesaplamalı yöntemleri bir araya getirerek karmaşık biyolojik ve farmasötik problemlere yenilikçi çözümler geliştirmeyi hedeflemektedir.

Grubun araştırma faaliyetleri; bilgisayar destekli ilaç tasarımı (CADD), moleküler docking, moleküler dinamik simülasyonları, MM/PBSA ve MM/GBSA bağlanma enerjisi analizleri, farmakofor modelleme, sanal tarama, QSAR modelleme ve ADMET analizleri gibi ileri düzey hesaplamalı yaklaşımları kapsamaktadır. Bunun yanı sıra genomik, transkriptomik ve çoklu-omik veri analizleri, protein–ligand ve protein–DNA etkileşimlerinin modellenmesi, rekombinant DNA teknolojileri, gen klonlama ve heterolog protein ekspresyonu gibi deneysel moleküler biyoloji uygulamaları da grubun temel çalışma alanları arasında yer almaktadır.

BioCDD’nin temel amacı; kanser, nörodejeneratif hastalıklar, enfeksiyon hastalıkları ve metabolik hastalıklar başta olmak üzere önemli biyomedikal problemlere yönelik yeni biyolojik hedeflerin belirlenmesi ve yüksek biyolojik etkinliğe sahip yenilikçi ilaç adaylarının geliştirilmesidir. Bu doğrultuda grup, yapay zekâ, makine öğrenmesi, kemoinformatik ve moleküler modelleme yöntemlerini bütüncül bir yaklaşımla kullanmaktadır.

Araştırma grubu, Prof. Dr. Halil İbrahim Güler liderliğinde faaliyet göstermektedir. Prof. Güler’in uzmanlık alanları arasında biyoinformatik, moleküler modelleme, rekombinant DNA teknolojileri, plazmit replikasyon sistemlerinin karakterizasyonu, protein–DNA etkileşimlerinin modellenmesi ve hesaplamalı ilaç keşfi yer almaktadır. Çalışmaları, uluslararası hakemli yüksek etki faktörlü dergilerde yayımlanmış olup, moleküler biyoloji, biyoteknoloji ve hesaplamalı ilaç geliştirme alanlarına katkı sağlamaktadır.

BioCDD ayrıca lisans, yüksek lisans ve doktora düzeyindeki araştırmacıların eğitimine önem vermekte; disiplinler arası bilimsel iş birliklerini destekleyerek ulusal ve uluslararası düzeyde güçlü bir araştırma ekosistemi oluşturmayı amaçlamaktadır.