Yayınlar

Makaleler

From Handcrafted Focus Measurement Operators to Deep Learning: A Comprehensive Review of Shape from Focus Strategies

Doğan R. Ö., Doğan H., Çal S.
ARCHIVES OF COMPUTATIONAL METHODS IN ENGINEERING, cilt.1, sa.-, ss.1-14, 2026 (SCI-Expanded, Scopus)

Two-phase deep learning method for image fusion-based extended depth of focus

Danışmaz S., Doğan R. Ö., Doğan H.
JOURNAL OF SUPERCOMPUTING, cilt.81, sa.1298, ss.1-27, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

Swin transformer-based shape-from-focus technique for accurate 3D shape estimation

Doğan R. Ö., Doğan H., Yılmaz A.
OPTICS AND LASERS IN ENGINEERING, cilt.193, ss.109108, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

Kan Hücrelerinin Optimum Odaklı Görüntülenmesi için Derin Öğrenme Tabanlı Yaklaşımın Geliştirilmesi

DOĞU F. T., Danaei Z., DOĞAN H., DOĞAN R. Ö., SEZEN F. S.
KSÜ Mühendislik Bilimleri Dergisi, cilt.27, sa.4, ss.1465-1476, 2024 (TRDizin)

A higher performance shape from focus strategy based on unsupervised deep learning for 3D shape reconstruction

DOĞAN H.
Multimedia Tools and Applications, cilt.83, sa.12, ss.35825-35848, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)

DL-EDOF: Novel Multi-Focus Image Data Set and Deep Learning-Based Approach for More Accurate and Specimen-Free Extended Depth of Focus

Doğan H., Doğan R. Ö., Ay İ., Sezen F. S.
Journal of Imaging Informatics in Medicine, cilt.1, sa.37, ss.1991-2013, 2024 (SCI-Expanded)

INVESTIGATION OF EFFECTS OF DEEP FEATURES ON FOCUS VALUES EXTRACTION IN EXTENDED DEPTH OF FOCUS

Danışmaz S., Emir S. N., Doğan H., Doğan R. Ö.
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi, cilt.31, sa.3, ss.917-930, 2023 (TRDizin)

Floresan Mikroskop Sistemlerinde Yüksek Doğruluklu Nükleer Segmentasyonu için Otomatik Kodlayıcı Tabanlı Modellerin Geliştirilmesi

Emir S. N., Danışmaz S., DOĞAN H., DOĞAN R. Ö.
Karadeniz Fen Bilimleri Dergisi, cilt.13, sa.3, ss.801-813, 2023 (TRDizin)

İlaç - İlaç Etkileşimi Tahmini için Konvolüsyonel Sinir Ağı Tabanlı Yeni Bir Yaklaşım

DOĞAN R. Ö., DOĞAN H., SEZEN F. S.
Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, cilt.27, sa.1, ss.137-144, 2023 (TRDizin)

A New High Quality Focus Measurement Operator Based on Nonsubsampled Shearlet Transform for 3D Shape Reconstruction

DOĞAN H., DOĞAN R. Ö.
Mühendislik bilimleri ve araştırmaları dergisi (Online), cilt.5, sa.1, ss.9-19, 2023 (TRDizin)

Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

Deep Learning-Based Image Fusion with Novel Multi-Focus Dataset for Extended Depth of Focus in Microscopy

Doğan R. Ö., Doğu F. T., Santos De Olıveıra N., Kannada I., Doğan H., Sezen F. S.
International Conference on SMART MULTIMEDIA, Paris, Fransa, 19 - 21 Aralık 2025, ss.1-7, (Tam Metin Bildiri)

Mechanism of Action of Pharmacological Agents: A New Deep Learning-based Prediction Model Using Smooth Muscle Contractility Signals

DOĞU F. T., DOĞAN R. Ö., DOĞAN H., AY İ., Kalha Z., KAYA YAŞAR Y., et al.
The 12th International Conference on Computer Technology Applications (ICCTA 2026), Vienna, Avusturya, 16 - 19 Haziran 2026, (Tam Metin Bildiri)

A Novel Neuro-Focus Fusion Framework for Fully Focused Microscopic Imaging

Aktürk B., DOĞAN R. Ö., UZUN Ü., SEZEN F. S., DOĞAN H.
The 12th International Conference on Computer Technology Applications (ICCTA 2026), Vienna, Avusturya, 16 Haziran 2026, (Tam Metin Bildiri)

Creation of an Novel Dataset and VGG-UNet Based Deep LearningApproach for Automated Blood Cell Segmentation

Emir S. N., Doğan R. Ö., Doğan H., Ay İ.
11. Uluslararası Sağlık Bilimleri ve Yönetimi Kongresi (IHMC 2026), Konya, Türkiye, 6 Mayıs - 08 Temmuz 2026, (Özet Bildiri)

Mikroskobik Sistemlerde 3B Görüntüleme için Derin Öğrenme Tabanlı Odaklama Ölçüm Operatörü

Doğan H., Doğan R. Ö.
31. IEEE Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları Kurultayı, İstanbul, Türkiye, 5 - 08 Temmuz 2023, ss.1-4, (Tam Metin Bildiri)

Enhanced Multi-Head Self-Attention Transformer-Based Method for Prediction of Drug-Drug Interactions

CAL S., DOĞAN R. Ö., DOĞAN H.
International Symposium on Digital Forensics and Security (ISDFS), Boston, Amerika Birleşik Devletleri, 24 - 25 Nisan 2025, (Tam Metin Bildiri)

Extracting 3D Structure of Blood Cells Using Shape From Focus Strategies

DOĞU F. T., DOĞAN H., DOĞAN R. Ö., AY İ., SEZEN F. S.
2024 Innovations in Intelligent Systems and Applications Conference (ASYU, Ankara, Türkiye, 16 Ekim 2024, (Tam Metin Bildiri)

An Efficient Technique based on Deep Learning for Automatic Focusing in Microscopic System

Doğu F. T., Doğan H., Doğan R. Ö., Ay İ., Sezen F. S.
2nd INTERNATIONAL CONGRESS of ELECTRICAL and COMPUTER ENGINEERING, Balıkesir, Türkiye, 22 - 25 Kasım 2023, ss.1-6, (Tam Metin Bildiri)

An Extensive Study: Creation of A New Inverted Microscope Image Data Set and Improving Auto-Encoder Models for Higher Accuracy Segmentation of HaCaT Cell Culture Line

Sevim Z., DOĞAN H., DEMİR ÖKSÜZ Z., SEZEN F. S., DOĞAN R. Ö.
5th International Congress on Human-Computer Interaction, Optimization and Robotic Applications, 08 Haziran 2023, ss.1-6, (Tam Metin Bildiri)

Performance Improvement in Blood Cell Segmentation with Deep Learning-based Image Fusion Approach

Doğu F. T., Doğan H., Doğan R. Ö., Sezen F. S.
8th International Artificial Intelligence and Data Processing Symposium (IDAP’24), Malatya, Türkiye, 21 - 22 Eylül 2024, ss.1-6, (Tam Metin Bildiri)